Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VtnP29788 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms