Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprmP28828 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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