Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RxraP28700 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RxraP28700 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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