Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BgnP28653 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BgnP28653 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BgnP28653 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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