Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms