Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2afxP27661 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms