Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChgaP26339 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChgaP26339 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms