Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd247P24161 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms