Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms