Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd8P23463 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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