Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RarbP22605 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RarbP22605 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RarbP22605 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RarbP22605 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RarbP22605 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RarbP22605 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RarbP22605 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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