Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gna11P21278 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gna11P21278 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms