Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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