Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps6ka1P18653 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms