Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PtpraP18052 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtpraP18052 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtpraP18052 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtpraP18052 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PtpraP18052 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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