Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms