Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmnb1P14733 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms