Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms