Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms