Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Schip1P0DPB4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Schip1P0DPB4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms