Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms