Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alkbh1P0CB42 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms