Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Spta1P08032 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Spta1P08032 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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