Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TtrP07309 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TtrP07309 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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TtrP07309 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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TtrP07309 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TtrP07309 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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