Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfrbP05622 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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