Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01645 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01645 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01645 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01645 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01645 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01645 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01645 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01645 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms