Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sp1O89090 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp1O89090 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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