Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CopeO89079 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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