Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AfmO89020 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AfmO89020 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AfmO89020 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AfmO89020 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms