Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BlmO88700 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BlmO88700 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BlmO88700 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BlmO88700 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BlmO88700 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BlmO88700 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BlmO88700 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BlmO88700 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BlmO88700 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms