Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Parp2O88554 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Parp2O88554 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms