Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Shoc2O88520 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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