Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copb2O55029 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copb2O55029 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Copb2O55029 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms