Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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