Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smarce1O54941 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms