Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms