Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FxnO35943 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FxnO35943 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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