Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nek2O35942 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek2O35942 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms