Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms