Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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