Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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