Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc27a2O35488 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a2O35488 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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