Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xbp1O35426 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms