Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmiO35309 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmiO35309 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmiO35309 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmiO35309 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmiO35309 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmiO35309 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NmiO35309 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms