Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ptpn9O35239 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms