Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ArxO35085 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ArxO35085 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms