Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LhbO09108 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LhbO09108 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LhbO09108 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LhbO09108 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LhbO09108 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms