Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Eftud2O08810 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms