Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp35M0QWN7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp35M0QWN7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp35M0QWN7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp35M0QWN7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp35M0QWN7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp35M0QWN7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp35M0QWN7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp35M0QWN7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp35M0QWN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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