Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm20878L7N244 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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